首先，观察巴西龟的眼睛肿胀的原因。常见的诱因有感染、异物、水质问题和营养不良等。在确定病因之前，切勿盲目用药，以免加重病情。

如果巴西龟的眼睛肿胀是由感染引起的，可以采取以下措施：

1. 保持水族箱水质清洁。使用水质检测工具定期检查水质，确保氨、亚硝酸盐和硝酸盐等有害物质含量处于正常范围。

2. 使用适合巴西龟的抗生素，如土霉素、氟哌酸等。请在兽医的建议下使用药物，并严格按照说明书的剂量和频率给药。

3. 给巴西龟进行眼部清洁。使用无菌棉签轻轻擦拭眼部，但注意不要用力，以免损伤眼睛。

若巴西龟的眼睛肿胀是由水质问题引起的，请采取以下措施：

1. 改善水族箱水质。定期更换水族箱内的水，可适当调整水温和pH值，以适应巴西龟的生长环境。

2. 使用水质调节剂，如盐度调节剂，调整水族箱的水质，以缓解眼睛肿胀症状。

若巴西龟的眼睛肿胀是由异物引起的，请尽快将其取出。可在兽医的指导下进行眼部异物取出手术，以减轻肿胀症状。

此外，合理安排巴西龟的饮食，确保其摄入充足的营养，有助于缓解眼睛肿胀问题。建议投喂巴西龟富含蛋白质、维生素和矿物质的饲料，如活鱼、鱼浆、水生植物等。